Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPOCK3Q9BQ16 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SPOCK3Q9BQ16 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPOCK3Q9BQ16 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPOCK3Q9BQ16 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPOCK3Q9BQ16 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPOCK3Q9BQ16 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPOCK3Q9BQ16 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPOCK3Q9BQ16 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPOCK3Q9BQ16 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPOCK3Q9BQ16 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPOCK3Q9BQ16 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPOCK3Q9BQ16 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPOCK3Q9BQ16 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPOCK3Q9BQ16 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPOCK3Q9BQ16 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPOCK3Q9BQ16 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPOCK3Q9BQ16 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPOCK3Q9BQ16 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SPOCK3Q9BQ16 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPOCK3Q9BQ16 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPOCK3Q9BQ16 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPOCK3Q9BQ16 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPOCK3Q9BQ16 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPOCK3Q9BQ16 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPOCK3Q9BQ16 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPOCK3Q9BQ16 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPOCK3Q9BQ16 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPOCK3Q9BQ16 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPOCK3Q9BQ16 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPOCK3Q9BQ16 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPOCK3Q9BQ16 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPOCK3Q9BQ16 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPOCK3Q9BQ16 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPOCK3Q9BQ16 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPOCK3Q9BQ16 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPOCK3Q9BQ16 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPOCK3Q9BQ16 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPOCK3Q9BQ16 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPOCK3Q9BQ16 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPOCK3Q9BQ16 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPOCK3Q9BQ16 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPOCK3Q9BQ16 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPOCK3Q9BQ16 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPOCK3Q9BQ16 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SPOCK3Q9BQ16 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPOCK3Q9BQ16 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPOCK3Q9BQ16 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPOCK3Q9BQ16 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPOCK3Q9BQ16 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SPOCK3Q9BQ16 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPOCK3Q9BQ16 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPOCK3Q9BQ16 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPOCK3Q9BQ16 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPOCK3Q9BQ16 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPOCK3Q9BQ16 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SPOCK3Q9BQ16 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPOCK3Q9BQ16 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPOCK3Q9BQ16 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms