Protein–RNA interactions for Protein: Q99698

LYST, Lysosomal-trafficking regulator, humanhuman

Predictions only

Length 3,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSTQ99698 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
LYSTQ99698 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LYSTQ99698 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LYSTQ99698 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LYSTQ99698 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LYSTQ99698 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LYSTQ99698 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LYSTQ99698 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LYSTQ99698 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LYSTQ99698 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LYSTQ99698 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LYSTQ99698 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LYSTQ99698 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
LYSTQ99698 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LYSTQ99698 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LYSTQ99698 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LYSTQ99698 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LYSTQ99698 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LYSTQ99698 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LYSTQ99698 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LYSTQ99698 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LYSTQ99698 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LYSTQ99698 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LYSTQ99698 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LYSTQ99698 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LYSTQ99698 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LYSTQ99698 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LYSTQ99698 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LYSTQ99698 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LYSTQ99698 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LYSTQ99698 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LYSTQ99698 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LYSTQ99698 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LYSTQ99698 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LYSTQ99698 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LYSTQ99698 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LYSTQ99698 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LYSTQ99698 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LYSTQ99698 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LYSTQ99698 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LYSTQ99698 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LYSTQ99698 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LYSTQ99698 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LYSTQ99698 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LYSTQ99698 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LYSTQ99698 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LYSTQ99698 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LYSTQ99698 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LYSTQ99698 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LYSTQ99698 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LYSTQ99698 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LYSTQ99698 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LYSTQ99698 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LYSTQ99698 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LYSTQ99698 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LYSTQ99698 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LYSTQ99698 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LYSTQ99698 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LYSTQ99698 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LYSTQ99698 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LYSTQ99698 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LYSTQ99698 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
LYSTQ99698 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LYSTQ99698 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LYSTQ99698 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LYSTQ99698 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LYSTQ99698 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LYSTQ99698 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LYSTQ99698 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LYSTQ99698 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LYSTQ99698 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
LYSTQ99698 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LYSTQ99698 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LYSTQ99698 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LYSTQ99698 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LYSTQ99698 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LYSTQ99698 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LYSTQ99698 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LYSTQ99698 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LYSTQ99698 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LYSTQ99698 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LYSTQ99698 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LYSTQ99698 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LYSTQ99698 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LYSTQ99698 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LYSTQ99698 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LYSTQ99698 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LYSTQ99698 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LYSTQ99698 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LYSTQ99698 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LYSTQ99698 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LYSTQ99698 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LYSTQ99698 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LYSTQ99698 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LYSTQ99698 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LYSTQ99698 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LYSTQ99698 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LYSTQ99698 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LYSTQ99698 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LYSTQ99698 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms