Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SENP8Q96LD8 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SENP8Q96LD8 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SENP8Q96LD8 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SENP8Q96LD8 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SENP8Q96LD8 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SENP8Q96LD8 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SENP8Q96LD8 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SENP8Q96LD8 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SENP8Q96LD8 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SENP8Q96LD8 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SENP8Q96LD8 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SENP8Q96LD8 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SENP8Q96LD8 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SENP8Q96LD8 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SENP8Q96LD8 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SENP8Q96LD8 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SENP8Q96LD8 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SENP8Q96LD8 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SENP8Q96LD8 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SENP8Q96LD8 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SENP8Q96LD8 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SENP8Q96LD8 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SENP8Q96LD8 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SENP8Q96LD8 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SENP8Q96LD8 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SENP8Q96LD8 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SENP8Q96LD8 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SENP8Q96LD8 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SENP8Q96LD8 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SENP8Q96LD8 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SENP8Q96LD8 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SENP8Q96LD8 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SENP8Q96LD8 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SENP8Q96LD8 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SENP8Q96LD8 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SENP8Q96LD8 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SENP8Q96LD8 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SENP8Q96LD8 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SENP8Q96LD8 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SENP8Q96LD8 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SENP8Q96LD8 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SENP8Q96LD8 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SENP8Q96LD8 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SENP8Q96LD8 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SENP8Q96LD8 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SENP8Q96LD8 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SENP8Q96LD8 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SENP8Q96LD8 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SENP8Q96LD8 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SENP8Q96LD8 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SENP8Q96LD8 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SENP8Q96LD8 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SENP8Q96LD8 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SENP8Q96LD8 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SENP8Q96LD8 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SENP8Q96LD8 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SENP8Q96LD8 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SENP8Q96LD8 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SENP8Q96LD8 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SENP8Q96LD8 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SENP8Q96LD8 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SENP8Q96LD8 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SENP8Q96LD8 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SENP8Q96LD8 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SENP8Q96LD8 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SENP8Q96LD8 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SENP8Q96LD8 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SENP8Q96LD8 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SENP8Q96LD8 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SENP8Q96LD8 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SENP8Q96LD8 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SENP8Q96LD8 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SENP8Q96LD8 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SENP8Q96LD8 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SENP8Q96LD8 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SENP8Q96LD8 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SENP8Q96LD8 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SENP8Q96LD8 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SENP8Q96LD8 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SENP8Q96LD8 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SENP8Q96LD8 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SENP8Q96LD8 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SENP8Q96LD8 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SENP8Q96LD8 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SENP8Q96LD8 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SENP8Q96LD8 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SENP8Q96LD8 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SENP8Q96LD8 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SENP8Q96LD8 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SENP8Q96LD8 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SENP8Q96LD8 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SENP8Q96LD8 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SENP8Q96LD8 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SENP8Q96LD8 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SENP8Q96LD8 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SENP8Q96LD8 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SENP8Q96LD8 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SENP8Q96LD8 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SENP8Q96LD8 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms