Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRG4Q92954 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRG4Q92954 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PRG4Q92954 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRG4Q92954 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRG4Q92954 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRG4Q92954 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRG4Q92954 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRG4Q92954 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRG4Q92954 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRG4Q92954 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRG4Q92954 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRG4Q92954 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRG4Q92954 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRG4Q92954 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PRG4Q92954 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRG4Q92954 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRG4Q92954 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRG4Q92954 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRG4Q92954 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRG4Q92954 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRG4Q92954 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRG4Q92954 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRG4Q92954 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRG4Q92954 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRG4Q92954 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRG4Q92954 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRG4Q92954 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PRG4Q92954 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PRG4Q92954 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRG4Q92954 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRG4Q92954 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRG4Q92954 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRG4Q92954 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRG4Q92954 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRG4Q92954 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRG4Q92954 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRG4Q92954 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRG4Q92954 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRG4Q92954 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRG4Q92954 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRG4Q92954 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRG4Q92954 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRG4Q92954 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRG4Q92954 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PRG4Q92954 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRG4Q92954 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRG4Q92954 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRG4Q92954 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRG4Q92954 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRG4Q92954 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PRG4Q92954 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRG4Q92954 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRG4Q92954 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PRG4Q92954 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRG4Q92954 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRG4Q92954 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRG4Q92954 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRG4Q92954 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRG4Q92954 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRG4Q92954 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRG4Q92954 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRG4Q92954 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PRG4Q92954 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRG4Q92954 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRG4Q92954 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRG4Q92954 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRG4Q92954 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PRG4Q92954 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRG4Q92954 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRG4Q92954 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRG4Q92954 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRG4Q92954 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRG4Q92954 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRG4Q92954 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRG4Q92954 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRG4Q92954 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRG4Q92954 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRG4Q92954 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRG4Q92954 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRG4Q92954 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRG4Q92954 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRG4Q92954 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRG4Q92954 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRG4Q92954 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms