Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms