Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms