Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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