Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP7

KLHDC9, Kelch domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC9Q8NEP7 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms