Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEJ9

NGDN, Neuroguidin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGDNQ8NEJ9 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NGDNQ8NEJ9 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NGDNQ8NEJ9 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NGDNQ8NEJ9 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NGDNQ8NEJ9 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NGDNQ8NEJ9 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NGDNQ8NEJ9 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NGDNQ8NEJ9 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NGDNQ8NEJ9 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NGDNQ8NEJ9 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NGDNQ8NEJ9 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NGDNQ8NEJ9 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NGDNQ8NEJ9 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NGDNQ8NEJ9 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NGDNQ8NEJ9 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NGDNQ8NEJ9 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NGDNQ8NEJ9 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NGDNQ8NEJ9 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NGDNQ8NEJ9 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NGDNQ8NEJ9 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NGDNQ8NEJ9 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NGDNQ8NEJ9 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NGDNQ8NEJ9 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NGDNQ8NEJ9 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NGDNQ8NEJ9 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NGDNQ8NEJ9 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NGDNQ8NEJ9 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NGDNQ8NEJ9 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NGDNQ8NEJ9 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NGDNQ8NEJ9 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NGDNQ8NEJ9 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NGDNQ8NEJ9 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NGDNQ8NEJ9 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NGDNQ8NEJ9 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NGDNQ8NEJ9 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NGDNQ8NEJ9 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NGDNQ8NEJ9 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NGDNQ8NEJ9 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NGDNQ8NEJ9 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NGDNQ8NEJ9 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NGDNQ8NEJ9 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NGDNQ8NEJ9 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NGDNQ8NEJ9 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NGDNQ8NEJ9 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NGDNQ8NEJ9 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NGDNQ8NEJ9 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NGDNQ8NEJ9 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NGDNQ8NEJ9 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NGDNQ8NEJ9 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NGDNQ8NEJ9 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NGDNQ8NEJ9 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NGDNQ8NEJ9 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NGDNQ8NEJ9 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NGDNQ8NEJ9 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NGDNQ8NEJ9 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NGDNQ8NEJ9 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NGDNQ8NEJ9 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NGDNQ8NEJ9 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NGDNQ8NEJ9 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NGDNQ8NEJ9 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NGDNQ8NEJ9 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NGDNQ8NEJ9 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NGDNQ8NEJ9 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NGDNQ8NEJ9 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NGDNQ8NEJ9 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NGDNQ8NEJ9 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NGDNQ8NEJ9 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NGDNQ8NEJ9 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NGDNQ8NEJ9 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NGDNQ8NEJ9 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NGDNQ8NEJ9 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NGDNQ8NEJ9 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NGDNQ8NEJ9 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NGDNQ8NEJ9 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NGDNQ8NEJ9 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NGDNQ8NEJ9 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NGDNQ8NEJ9 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NGDNQ8NEJ9 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NGDNQ8NEJ9 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NGDNQ8NEJ9 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NGDNQ8NEJ9 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NGDNQ8NEJ9 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NGDNQ8NEJ9 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NGDNQ8NEJ9 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NGDNQ8NEJ9 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NGDNQ8NEJ9 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NGDNQ8NEJ9 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NGDNQ8NEJ9 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NGDNQ8NEJ9 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NGDNQ8NEJ9 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NGDNQ8NEJ9 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NGDNQ8NEJ9 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NGDNQ8NEJ9 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NGDNQ8NEJ9 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NGDNQ8NEJ9 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NGDNQ8NEJ9 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NGDNQ8NEJ9 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NGDNQ8NEJ9 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NGDNQ8NEJ9 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NGDNQ8NEJ9 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms