Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 DCD-201ENST00000293371 645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms