Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VSTM1Q6UX27 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms