Protein–RNA interactions for Protein: Q6GPH4

XAF1, XIAP-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XAF1Q6GPH4 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
XAF1Q6GPH4 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
XAF1Q6GPH4 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XAF1Q6GPH4 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
XAF1Q6GPH4 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
XAF1Q6GPH4 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XAF1Q6GPH4 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
XAF1Q6GPH4 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
XAF1Q6GPH4 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XAF1Q6GPH4 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XAF1Q6GPH4 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XAF1Q6GPH4 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
XAF1Q6GPH4 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XAF1Q6GPH4 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
XAF1Q6GPH4 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XAF1Q6GPH4 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XAF1Q6GPH4 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
XAF1Q6GPH4 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
XAF1Q6GPH4 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
XAF1Q6GPH4 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
XAF1Q6GPH4 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
XAF1Q6GPH4 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
XAF1Q6GPH4 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
XAF1Q6GPH4 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
XAF1Q6GPH4 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
XAF1Q6GPH4 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
XAF1Q6GPH4 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
XAF1Q6GPH4 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
XAF1Q6GPH4 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
XAF1Q6GPH4 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
XAF1Q6GPH4 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
XAF1Q6GPH4 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
XAF1Q6GPH4 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
XAF1Q6GPH4 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
XAF1Q6GPH4 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
XAF1Q6GPH4 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
XAF1Q6GPH4 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
XAF1Q6GPH4 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
XAF1Q6GPH4 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
XAF1Q6GPH4 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
XAF1Q6GPH4 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
XAF1Q6GPH4 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
XAF1Q6GPH4 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
XAF1Q6GPH4 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
XAF1Q6GPH4 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
XAF1Q6GPH4 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
XAF1Q6GPH4 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
XAF1Q6GPH4 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
XAF1Q6GPH4 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
XAF1Q6GPH4 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
XAF1Q6GPH4 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
XAF1Q6GPH4 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
XAF1Q6GPH4 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
XAF1Q6GPH4 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
XAF1Q6GPH4 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
XAF1Q6GPH4 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
XAF1Q6GPH4 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
XAF1Q6GPH4 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
XAF1Q6GPH4 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
XAF1Q6GPH4 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
XAF1Q6GPH4 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
XAF1Q6GPH4 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
XAF1Q6GPH4 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
XAF1Q6GPH4 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
XAF1Q6GPH4 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
XAF1Q6GPH4 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
XAF1Q6GPH4 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
XAF1Q6GPH4 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
XAF1Q6GPH4 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
XAF1Q6GPH4 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
XAF1Q6GPH4 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
XAF1Q6GPH4 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
XAF1Q6GPH4 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
XAF1Q6GPH4 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
XAF1Q6GPH4 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
XAF1Q6GPH4 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
XAF1Q6GPH4 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
XAF1Q6GPH4 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
XAF1Q6GPH4 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
XAF1Q6GPH4 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
XAF1Q6GPH4 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
XAF1Q6GPH4 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
XAF1Q6GPH4 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
XAF1Q6GPH4 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
XAF1Q6GPH4 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
XAF1Q6GPH4 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
XAF1Q6GPH4 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
XAF1Q6GPH4 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
XAF1Q6GPH4 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
XAF1Q6GPH4 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
XAF1Q6GPH4 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
XAF1Q6GPH4 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
XAF1Q6GPH4 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
XAF1Q6GPH4 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
XAF1Q6GPH4 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
XAF1Q6GPH4 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
XAF1Q6GPH4 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
XAF1Q6GPH4 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
XAF1Q6GPH4 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
XAF1Q6GPH4 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms