Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWM4

PRAMEF8, PRAME family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF8Q5VWM4 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms