Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC93Q567U6 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms