Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms