Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 DCAF4-203ENST00000394234 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 TJAP1-205ENST00000372452 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 AC099521.2-201ENST00000619354 2036 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms