Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPHKAPQ2M3C7 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPHKAPQ2M3C7 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPHKAPQ2M3C7 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPHKAPQ2M3C7 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPHKAPQ2M3C7 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPHKAPQ2M3C7 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPHKAPQ2M3C7 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPHKAPQ2M3C7 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPHKAPQ2M3C7 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPHKAPQ2M3C7 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPHKAPQ2M3C7 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SPHKAPQ2M3C7 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPHKAPQ2M3C7 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPHKAPQ2M3C7 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPHKAPQ2M3C7 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPHKAPQ2M3C7 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPHKAPQ2M3C7 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPHKAPQ2M3C7 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPHKAPQ2M3C7 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPHKAPQ2M3C7 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SPHKAPQ2M3C7 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPHKAPQ2M3C7 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPHKAPQ2M3C7 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPHKAPQ2M3C7 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPHKAPQ2M3C7 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPHKAPQ2M3C7 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPHKAPQ2M3C7 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SPHKAPQ2M3C7 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPHKAPQ2M3C7 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SPHKAPQ2M3C7 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPHKAPQ2M3C7 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPHKAPQ2M3C7 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPHKAPQ2M3C7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPHKAPQ2M3C7 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPHKAPQ2M3C7 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPHKAPQ2M3C7 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPHKAPQ2M3C7 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPHKAPQ2M3C7 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPHKAPQ2M3C7 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SPHKAPQ2M3C7 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPHKAPQ2M3C7 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SPHKAPQ2M3C7 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPHKAPQ2M3C7 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPHKAPQ2M3C7 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPHKAPQ2M3C7 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPHKAPQ2M3C7 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPHKAPQ2M3C7 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPHKAPQ2M3C7 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPHKAPQ2M3C7 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPHKAPQ2M3C7 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPHKAPQ2M3C7 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPHKAPQ2M3C7 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPHKAPQ2M3C7 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPHKAPQ2M3C7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPHKAPQ2M3C7 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPHKAPQ2M3C7 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPHKAPQ2M3C7 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPHKAPQ2M3C7 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPHKAPQ2M3C7 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPHKAPQ2M3C7 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPHKAPQ2M3C7 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPHKAPQ2M3C7 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPHKAPQ2M3C7 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPHKAPQ2M3C7 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SPHKAPQ2M3C7 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPHKAPQ2M3C7 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPHKAPQ2M3C7 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPHKAPQ2M3C7 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPHKAPQ2M3C7 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPHKAPQ2M3C7 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPHKAPQ2M3C7 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPHKAPQ2M3C7 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPHKAPQ2M3C7 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPHKAPQ2M3C7 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPHKAPQ2M3C7 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPHKAPQ2M3C7 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPHKAPQ2M3C7 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPHKAPQ2M3C7 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPHKAPQ2M3C7 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPHKAPQ2M3C7 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPHKAPQ2M3C7 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SPHKAPQ2M3C7 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPHKAPQ2M3C7 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SPHKAPQ2M3C7 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPHKAPQ2M3C7 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPHKAPQ2M3C7 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPHKAPQ2M3C7 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPHKAPQ2M3C7 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPHKAPQ2M3C7 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPHKAPQ2M3C7 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPHKAPQ2M3C7 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPHKAPQ2M3C7 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SPHKAPQ2M3C7 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPHKAPQ2M3C7 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SPHKAPQ2M3C7 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPHKAPQ2M3C7 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SPHKAPQ2M3C7 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPHKAPQ2M3C7 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPHKAPQ2M3C7 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
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