Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HADHQ16836 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HADHQ16836 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HADHQ16836 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HADHQ16836 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HADHQ16836 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HADHQ16836 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HADHQ16836 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HADHQ16836 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HADHQ16836 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HADHQ16836 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HADHQ16836 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HADHQ16836 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HADHQ16836 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HADHQ16836 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HADHQ16836 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HADHQ16836 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HADHQ16836 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HADHQ16836 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HADHQ16836 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HADHQ16836 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HADHQ16836 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HADHQ16836 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HADHQ16836 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HADHQ16836 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HADHQ16836 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HADHQ16836 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HADHQ16836 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HADHQ16836 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HADHQ16836 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HADHQ16836 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HADHQ16836 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HADHQ16836 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HADHQ16836 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HADHQ16836 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HADHQ16836 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HADHQ16836 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HADHQ16836 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HADHQ16836 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HADHQ16836 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HADHQ16836 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HADHQ16836 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HADHQ16836 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HADHQ16836 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HADHQ16836 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HADHQ16836 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HADHQ16836 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HADHQ16836 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HADHQ16836 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HADHQ16836 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HADHQ16836 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HADHQ16836 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HADHQ16836 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HADHQ16836 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HADHQ16836 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HADHQ16836 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HADHQ16836 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HADHQ16836 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HADHQ16836 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HADHQ16836 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HADHQ16836 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HADHQ16836 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HADHQ16836 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HADHQ16836 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HADHQ16836 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HADHQ16836 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HADHQ16836 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HADHQ16836 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HADHQ16836 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HADHQ16836 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HADHQ16836 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HADHQ16836 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HADHQ16836 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HADHQ16836 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HADHQ16836 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HADHQ16836 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HADHQ16836 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HADHQ16836 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HADHQ16836 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HADHQ16836 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HADHQ16836 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HADHQ16836 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HADHQ16836 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HADHQ16836 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HADHQ16836 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HADHQ16836 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HADHQ16836 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HADHQ16836 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HADHQ16836 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HADHQ16836 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HADHQ16836 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HADHQ16836 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HADHQ16836 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HADHQ16836 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HADHQ16836 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HADHQ16836 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
HADHQ16836 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
HADHQ16836 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HADHQ16836 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HADHQ16836 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms