Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms