Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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