Protein–RNA interactions for Protein: Q16566

CAMK4, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type IV, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK4Q16566 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAMK4Q16566 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAMK4Q16566 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAMK4Q16566 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAMK4Q16566 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAMK4Q16566 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAMK4Q16566 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAMK4Q16566 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAMK4Q16566 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CAMK4Q16566 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CAMK4Q16566 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CAMK4Q16566 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAMK4Q16566 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAMK4Q16566 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAMK4Q16566 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAMK4Q16566 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAMK4Q16566 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAMK4Q16566 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAMK4Q16566 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAMK4Q16566 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAMK4Q16566 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAMK4Q16566 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAMK4Q16566 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAMK4Q16566 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAMK4Q16566 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAMK4Q16566 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAMK4Q16566 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAMK4Q16566 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CAMK4Q16566 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAMK4Q16566 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAMK4Q16566 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CAMK4Q16566 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAMK4Q16566 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAMK4Q16566 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAMK4Q16566 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CAMK4Q16566 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAMK4Q16566 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAMK4Q16566 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAMK4Q16566 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAMK4Q16566 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAMK4Q16566 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAMK4Q16566 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAMK4Q16566 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAMK4Q16566 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAMK4Q16566 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAMK4Q16566 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAMK4Q16566 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAMK4Q16566 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAMK4Q16566 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAMK4Q16566 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAMK4Q16566 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAMK4Q16566 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAMK4Q16566 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAMK4Q16566 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAMK4Q16566 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAMK4Q16566 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAMK4Q16566 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAMK4Q16566 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAMK4Q16566 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAMK4Q16566 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAMK4Q16566 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CAMK4Q16566 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAMK4Q16566 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAMK4Q16566 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAMK4Q16566 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAMK4Q16566 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAMK4Q16566 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAMK4Q16566 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAMK4Q16566 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAMK4Q16566 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAMK4Q16566 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAMK4Q16566 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CAMK4Q16566 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CAMK4Q16566 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CAMK4Q16566 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CAMK4Q16566 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CAMK4Q16566 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CAMK4Q16566 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CAMK4Q16566 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CAMK4Q16566 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CAMK4Q16566 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CAMK4Q16566 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CAMK4Q16566 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CAMK4Q16566 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CAMK4Q16566 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CAMK4Q16566 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CAMK4Q16566 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CAMK4Q16566 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CAMK4Q16566 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CAMK4Q16566 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CAMK4Q16566 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CAMK4Q16566 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CAMK4Q16566 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CAMK4Q16566 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CAMK4Q16566 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CAMK4Q16566 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CAMK4Q16566 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CAMK4Q16566 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CAMK4Q16566 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CAMK4Q16566 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms