Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms