Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
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