Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms