Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
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