Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCN9AQ15858 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCN9AQ15858 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCN9AQ15858 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCN9AQ15858 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCN9AQ15858 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCN9AQ15858 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SCN9AQ15858 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SCN9AQ15858 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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