Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
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