Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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