Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
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COL9A3Q14050 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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COL9A3Q14050 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
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