Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDK13Q14004 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
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