Protein–RNA interactions for Protein: Q13946

PDE7A, High affinity cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7A, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7AQ13946 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms