Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2H2Q13888 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2H2Q13888 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2H2Q13888 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2H2Q13888 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2H2Q13888 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2H2Q13888 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2H2Q13888 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2H2Q13888 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2H2Q13888 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2H2Q13888 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2H2Q13888 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2H2Q13888 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2H2Q13888 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2H2Q13888 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2H2Q13888 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2H2Q13888 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2H2Q13888 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2H2Q13888 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2H2Q13888 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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