Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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