Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
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