Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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