Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
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