Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PTPRSQ13332 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRSQ13332 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRSQ13332 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRSQ13332 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRSQ13332 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRSQ13332 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRSQ13332 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRSQ13332 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRSQ13332 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRSQ13332 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRSQ13332 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRSQ13332 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRSQ13332 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRSQ13332 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRSQ13332 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRSQ13332 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
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PTPRSQ13332 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRSQ13332 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRSQ13332 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRSQ13332 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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PTPRSQ13332 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRSQ13332 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRSQ13332 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRSQ13332 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
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PTPRSQ13332 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRSQ13332 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRSQ13332 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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PTPRSQ13332 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
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PTPRSQ13332 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRSQ13332 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
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PTPRSQ13332 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRSQ13332 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
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