Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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