Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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