Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
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