Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMAN2Q12907 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
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