Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GRIN2AQ12879 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GRIN2AQ12879 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GRIN2AQ12879 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GRIN2AQ12879 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GRIN2AQ12879 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
GRIN2AQ12879 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GRIN2AQ12879 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GRIN2AQ12879 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GRIN2AQ12879 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GRIN2AQ12879 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GRIN2AQ12879 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GRIN2AQ12879 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GRIN2AQ12879 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GRIN2AQ12879 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GRIN2AQ12879 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
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GRIN2AQ12879 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
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GRIN2AQ12879 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GRIN2AQ12879 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
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GRIN2AQ12879 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
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GRIN2AQ12879 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
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GRIN2AQ12879 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GRIN2AQ12879 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
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GRIN2AQ12879 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
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GRIN2AQ12879 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GRIN2AQ12879 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GRIN2AQ12879 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
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GRIN2AQ12879 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GRIN2AQ12879 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GRIN2AQ12879 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GRIN2AQ12879 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GRIN2AQ12879 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GRIN2AQ12879 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GRIN2AQ12879 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GRIN2AQ12879 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GRIN2AQ12879 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
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