Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SREBF2Q12772 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SREBF2Q12772 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SREBF2Q12772 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SREBF2Q12772 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SREBF2Q12772 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SREBF2Q12772 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SREBF2Q12772 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SREBF2Q12772 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SREBF2Q12772 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SREBF2Q12772 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SREBF2Q12772 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SREBF2Q12772 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SREBF2Q12772 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SREBF2Q12772 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SREBF2Q12772 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SREBF2Q12772 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SREBF2Q12772 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SREBF2Q12772 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SREBF2Q12772 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SREBF2Q12772 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SREBF2Q12772 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SREBF2Q12772 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SREBF2Q12772 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SREBF2Q12772 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SREBF2Q12772 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SREBF2Q12772 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SREBF2Q12772 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SREBF2Q12772 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SREBF2Q12772 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SREBF2Q12772 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SREBF2Q12772 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SREBF2Q12772 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SREBF2Q12772 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SREBF2Q12772 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SREBF2Q12772 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SREBF2Q12772 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SREBF2Q12772 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SREBF2Q12772 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SREBF2Q12772 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SREBF2Q12772 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SREBF2Q12772 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SREBF2Q12772 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SREBF2Q12772 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SREBF2Q12772 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SREBF2Q12772 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SREBF2Q12772 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SREBF2Q12772 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SREBF2Q12772 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SREBF2Q12772 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SREBF2Q12772 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SREBF2Q12772 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SREBF2Q12772 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SREBF2Q12772 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SREBF2Q12772 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SREBF2Q12772 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SREBF2Q12772 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SREBF2Q12772 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SREBF2Q12772 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SREBF2Q12772 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SREBF2Q12772 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SREBF2Q12772 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SREBF2Q12772 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SREBF2Q12772 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SREBF2Q12772 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SREBF2Q12772 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SREBF2Q12772 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SREBF2Q12772 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SREBF2Q12772 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SREBF2Q12772 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SREBF2Q12772 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SREBF2Q12772 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SREBF2Q12772 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SREBF2Q12772 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SREBF2Q12772 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SREBF2Q12772 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SREBF2Q12772 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SREBF2Q12772 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SREBF2Q12772 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SREBF2Q12772 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SREBF2Q12772 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SREBF2Q12772 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SREBF2Q12772 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SREBF2Q12772 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SREBF2Q12772 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SREBF2Q12772 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SREBF2Q12772 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SREBF2Q12772 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SREBF2Q12772 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SREBF2Q12772 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SREBF2Q12772 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SREBF2Q12772 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SREBF2Q12772 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SREBF2Q12772 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SREBF2Q12772 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SREBF2Q12772 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SREBF2Q12772 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SREBF2Q12772 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SREBF2Q12772 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SREBF2Q12772 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
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