Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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