Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms