Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms