Protein–RNA interactions for Protein: Q08AH1

ACSM1, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM1Q08AH1 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.05■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ACSM1Q08AH1 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms