Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms