Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms