Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
OC90Q02509 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
OC90Q02509 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
OC90Q02509 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
OC90Q02509 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
OC90Q02509 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
OC90Q02509 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
OC90Q02509 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
OC90Q02509 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
OC90Q02509 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
OC90Q02509 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
OC90Q02509 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
OC90Q02509 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
OC90Q02509 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
OC90Q02509 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
OC90Q02509 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
OC90Q02509 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OC90Q02509 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
OC90Q02509 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
OC90Q02509 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OC90Q02509 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OC90Q02509 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
OC90Q02509 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OC90Q02509 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
OC90Q02509 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OC90Q02509 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OC90Q02509 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OC90Q02509 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OC90Q02509 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
OC90Q02509 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
OC90Q02509 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
OC90Q02509 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
OC90Q02509 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
OC90Q02509 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
OC90Q02509 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
OC90Q02509 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OC90Q02509 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
OC90Q02509 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
OC90Q02509 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
OC90Q02509 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OC90Q02509 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
OC90Q02509 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
OC90Q02509 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OC90Q02509 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OC90Q02509 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OC90Q02509 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OC90Q02509 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OC90Q02509 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OC90Q02509 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OC90Q02509 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OC90Q02509 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OC90Q02509 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OC90Q02509 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OC90Q02509 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OC90Q02509 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OC90Q02509 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OC90Q02509 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OC90Q02509 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OC90Q02509 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OC90Q02509 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OC90Q02509 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OC90Q02509 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OC90Q02509 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OC90Q02509 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OC90Q02509 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OC90Q02509 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OC90Q02509 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OC90Q02509 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OC90Q02509 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OC90Q02509 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
OC90Q02509 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OC90Q02509 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OC90Q02509 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
OC90Q02509 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OC90Q02509 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OC90Q02509 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
OC90Q02509 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
OC90Q02509 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OC90Q02509 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OC90Q02509 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OC90Q02509 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OC90Q02509 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OC90Q02509 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OC90Q02509 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OC90Q02509 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OC90Q02509 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OC90Q02509 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OC90Q02509 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
OC90Q02509 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OC90Q02509 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OC90Q02509 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
OC90Q02509 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
OC90Q02509 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OC90Q02509 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
OC90Q02509 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
OC90Q02509 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OC90Q02509 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
OC90Q02509 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
OC90Q02509 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OC90Q02509 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms